而在战斗前两天，倭国又派出四艘潜艇，秘密派遣了五百名特攻队队员上岛，与之前的侦察人员会合，共同配合舰队对珍珠港展开袭击。八艘航母在悄无声息地航行后，终于抵达距离珍珠港五十海里的海域，此时，夏威夷时间正值早上四点。
岛上倭国的特攻队早已成功完成了多项关键任务。他们神不知鬼不觉地将珍珠港的通信中心、雷达站和机场的塔台占领，切断了米军的对外联系与情报获取渠道。并且，将珍珠港内舰船的详细变化情况做了精确汇报，包括舰船的数量、型号、停泊位置等信息。南云司令官在收到汇报后，立即让参谋人员进行仔细核对，结果发现与原来侦察的情况没有丝毫变动。情报的准确性，无疑是此次攻击能否达到奇袭效果的核心关键。一旦情报有误，整个袭击计划都可能功亏一篑，陷入米军的重重包围之中。
米国太平洋舰队此时正处于日常战备状态。三艘航母和几十艘战列舰、巡洋舰、驱逐舰、护卫舰和补给舰都静静地停泊在原来的码头，所有水兵都按照规定住在舰上。由于并非星期天，水兵们都处在战备值班状态，时刻保持着警惕。然而，他们万万没有想到，一场突如其来的灾难即将降临。
倭国制定了详细的作战计划。第一波的作战任务是集中力量将珍珠港港口内的航空母舰和各类舰船予以毁伤，同时瘫痪岛上的机场，使米军失去空中作战能力与海上反击力量。随后，由潜艇、战列舰、重型巡洋舰和轻型巡洋舰协同作战，对港口内的舰船、船坞和船舶修造厂进行全方位攻击，摧毁米军的海军基础设施，使其在短时间内难以恢复元气。第二波攻击则将目标锁定在山上的大型油库、机场和码头上的弹药库，这些都是米军在珍珠港的重要战略资源储备设施。一旦被摧毁，米军将面临能源短缺、弹药不足的困境，进一步削弱其战斗力与持续作战能力。
当四点整时，航空母舰按照作战计划放飞了侦察机和几架负责保护侦察机的战斗机，它们犹如尖兵一般，率先向珍珠港方向飞去，试图探测米军的防御情况。与此同时，潜艇则先期发动进攻，悄悄地向珍珠港港口靠近，战列舰、巡洋舰则紧紧跟进，形成了一个多层次的攻击梯队。
五点半的时候，潜艇已经悄然接近港口，战列舰和巡洋舰也距离港口仅有十公里之遥，航空母舰开始大规模放飞轰炸机。航空母舰上一片忙碌景象，地勤人员迅速将一架架轰炸机和战斗机推上跑道，随着引擎的轰鸣声响起，一次将所有轰炸机和战斗机全部放飞。战斗机在空中迅速组成编队，紧紧围绕在轰炸机周围，犹如一群护卫天使，共同向五十海里外的港口及大型机场前进。
当机场的雷达探测到犹如乌云般汹涌而来的飞机群时，米军雷达兵们顿时大惊失色，他们立刻准备转动空袭报警装置，然而，还未来得及发出警报，刚刚迈出两步的他们就被早已潜伏在附近的倭国特攻队人员残忍地抹了脖子。瞬间，机场陷入了一片死寂，米军失去了提前预警的机会。
军舰上的哨兵在第一时间发现了来袭的倭国轰炸机，他们本能地按响了防空警报，但此时为时已晚。倭国轰炸机如雨点般投下的低空炸弹，瞬间将军舰上的所有物体都无情地扫落到海中，那些刚刚从船舱内惊慌失措跑出来的水兵也未能幸免，许多人在炸弹的爆炸中丧生或受伤，军舰上顿时陷入一片混乱与火海之中。
倭国的战列舰和巡洋舰此时开足马力，迅速赶到珍珠港港口外。六艘潜艇则在港口内上浮，它们将前部的发射管精准对准停在港口中间的战列舰和巡洋舰，随着一声声沉闷的发射声响起，一次各发射了五枚鱼雷。鱼雷如离弦之箭，在海水中高速穿梭，直扑目标。
三艘航空母舰成为了倭国轰炸机的主攻焦点，由于毫无防备，此时的航空母舰就像静止不动的靶子，只能无奈地任由鱼雷俯冲攻击机和平飞轰炸机肆意轰炸。尽管航母上几十个防空炮位迅速做出反应，向空中倾泻着愤怒的炮火，但面对如此大规模、突然的袭击，大局已定。在短短半小时内，三艘航空母舰的甲板上便布满了七零八落燃烧着的飞机，爆炸引燃的飞机燃油四处流淌，形成一片火海。航空母舰船舷吃水以下更是被鱼雷炸出几个巨大的窟窿，海水汹涌而入，航母开始向一边缓缓倾覆，舰上的水兵们在绝望中挣扎求生。
几艘战列舰也遭到了潜艇鱼雷的重创，开始慢慢下沉。战列舰上的高射炮和高射机枪仍在顽强地向高空中的飞机抛洒着炮弹和子弹，试图进行最后的抵抗。但是，不断在船底发生的爆炸让这些努力都化为泡影。即便如此，英勇的水兵们还是不顾一切地向天空中的倭国飞机开火，他们用生命捍卫着自已的战舰与国家的尊严，直至战舰最终沉入水中。
发射完鱼雷的潜艇，一边迅速装填鱼雷，一边缓缓下潜，沉入水中躲避米国炮弹的猛烈进攻。倭国的战列舰和巡洋舰则在港口外排成战斗队形，几十门三百多毫米的舰炮和二百多毫米的舰炮齐声怒吼，向港口内被炸得千疮百孔的巡洋舰、驱逐舰和其他舰艇疯狂地发射着弹药。炮弹如雨点般落在米军舰艇上，引发一次次爆炸与火灾。
港口内的巡洋舰、驱逐舰和护卫舰由于遭受了突如其来的袭击，许多舰艇已经受损严重，根本无法做出有效的反击，只能眼睁睁地看着自已被倭国的战列舰和巡洋舰逐个点名攻击，在炮火中苦苦挣扎。
第一波攻击结束后，除了负责侦察的飞机和在空中执行护航任务的战斗机外，俯冲轰炸机和平行轰炸机都按照计划返回航母进行弹药加挂，准备迎接下一轮更为猛烈的攻击。而此时，港口外面倭国的战列舰和巡洋舰并没有停止攻击的脚步，它们继续向港口内那些还没有沉没的舰艇连续发射炮弹，试图将米军在珍珠港的海军力量彻底摧毁，为倭国的战略目标奠定坚实基础。