《X战警2》自然成为变种人的第四部电影。故事情节紧接上一部，金刚狼为了寻找自己失去的记忆，重回枫叶国的亚卡里湖工业区，却没能找到藏在底下的碱湖坝下基地。
变种人的夙敌史崔克重新上线，以一人之力谋算变种人两大巨头，只一步之差就能彻底灭绝全世界一千六百多万变种人。
史崔克与变种人的爱恨情仇，在这一电影中被交代得更加清晰。电影丰富了一条支线故事，就是从史崔克年轻时说起。
说史崔克和爱妻的儿子，詹姆斯，也是变种人。因此，史崔克一度放下对变种人的偏见，将儿子送去泽维尔上学。可当詹姆斯从学校回来后，却因没有控制好的能力，而杀死了自己的母亲，史崔克的妻子。
这就交代了在《金刚狼与剑齿虎》中，史崔克狩猎变种人，复活妻子的起因。又因为好不容易复活的妻子，被金刚狼与剑齿虎联手杀死，从而导致史崔克彻底仇恨整个变种人。这条支线为史崔克想要灭绝变种人的动机，平添了许多悲情色彩。
如此苦心经营起来的大反派，木兰当然不舍得让他就这么嗝屁，死亡女十人组成了史崔克死里求活的契机。
从《金刚狼与剑齿虎》的双男主开始，木兰就不断加大剑齿虎的戏份。谁让剑齿虎才是自己的丈人姥爷呢。cuxi.org 猪猪小说网
史崔克针对X战警与兄弟会的谋划，自然将加入兄弟会的剑齿虎牵扯其中。原金刚狼对死亡女的单挑，被木兰改成金刚狼与剑齿虎兄弟联手，对抗三位死亡女。变种人克隆技术，为《金刚狼3的暮狼归乡》埋下伏笔。
在《X战警2》中死亡女的人数被设置为五人，其中三位被金刚狼与剑齿虎联手杀死，剩下的两位在危急之中救下了史崔克。这也意味着，针对变种人武器计划将不会就此停止。
木兰对《X战警3》的剧情改动最小。电影的四大爆点，分别是X教授之死，金刚狼大战剑齿虎，万磁王搬运钢铁大桥，和金刚狼亲手杀死琴。金刚狼与剑齿虎的又一次单挑，发生在树林之中，这是木兰为了塑造情怀而唯一增加的剧情。
木兰有再三思考过，是否要在电影中“预言”NY世贸大楼的事件，反正万磁王在电影中玩的基本就是恐怖主义。最后想想还是算了，琴要的是美化变种人，而不是变种人恐怖主义化。木兰可不希望，如果这个时空重演世贸大楼事件，变种人要为此背锅。
虽然对整体剧情的改动较小，但木兰对结尾的改动却很大。就在大部分人以为是大团圆结局，米国总统在全世界面前与野兽握手言和之际，那两个作为背景墙的士兵，突然抽出暗藏的枪械，当着现场与屏幕前的观众之面，杀死了代表变种人发声的野兽。
没有仰望天空的金刚狼，也没有翱翔天际的天使长，在公园里下棋的万磁王被两位死亡女劫持，魔形女被秘密转移，小恶魔闪亮登场。
一部承前启后的变种人电影《逆转未来》成功转场。
自电影《金刚狼与剑齿虎》开始，金刚狼与剑齿虎就焦不离孟、孟不离焦。无坚不摧VS唯快不破，是这系列电影刻意营造出来的热门话题。同时，两兄弟的相爱相杀，也是串联电影系列的重要纽带。这些都被沿用到《逆转未来》中。
金刚狼还需要幻影猫的帮助，意识才能穿越回七十年代。剑齿虎则可以凭借自身的神速力，直接跑回去。穿越方式的不同，导致结果也不一样。金刚狼是意识回到自己身上，剑齿虎却是意识转嫁到快银身上。
剑齿虎获得神速力的来源，也在这里给与解释，就是掠夺自快银。这纯粹是木兰改编的电影设定，也是木兰对《逆转未来》的唯一改动。
在看过《逆转未来》之后，琴和木兰有过一段单独对话。
琴：“所以，在你的构想当中，我若是没有遇上你，就会和斯科特成为恋人，又与罗根暧昧不清，黑化后杀死斯科特和教授，最后死在罗根的怀里？”
木兰：“你知道，我在情感方面是个白痴···”
琴：“少扯，你能稳住那么大一个后宫，居然好意思说自己是情感白痴？”
木兰：“我说自己是情感白痴，主要指自己不懂得什么是真爱。这和女人多没有冲突。”
琴：“说白了，就是滥情。”
木兰：“滥情总好过绝情又痴情。咱们讨论过，没有遇上我，你迟早要黑化。这种黑化类似将你自我割裂为本我与超我，表现为本我压制超我。也就是因为本我的绝情，让你有可能杀死斯科特和查尔斯。当你的超我被罗根唤醒，痴情让你自愿死在罗根手里。”
琴：“三我理论？那要不要我感谢你的救命之恩？”
木兰：“不客气，咱俩谁跟谁。”
噼里啪啦、嘣呲哐叽。琴对木兰一顿拳脚相加，享受那乐人的手感与脚感后，说道：“那以咱俩的关系，你也肯定不会因此记恨我，对吧。”说完，还用脚将趴在地上的木兰挑翻躺过来。
木兰瘫软地躺在地上，呜咽着回答：“吧嘿”
将木兰揍了一顿，琴身心舒畅之后，总算想通了一个问题：自己即不需要痴情，也不需要无情。既然不认可“女人就要从一而终，女人不能水性杨花”这些道德束缚，她就完全没有遵守的必要。宠物可以养后宫，自己为什么就不行？
想到这，琴拿出一张名单，递给宠物，同时心灵传音：“帮我想想办法。”
木兰挪动眼珠，看完名单：白皇后、岩浆女、沙尘女、灵蝶、炫音、美梦、海妖。心里问：“这是什么？”
琴面不改色地回答：“我预备的后宫。”
摁，是的，凤凰女琴早在不知不觉中，成为了一名新潮的同好者。其中的起因或许能追溯到，木兰曾经设计的两段梦境，“X教授大战万磁王”和“米队大战托尼”。
木兰一大串震惊之语被琴禁言。琴：“别人还好说，艾玛和斯科特这一对比较麻烦，你给我出出主意。”
木兰眨眨眼，在心里说出一个歪招，琴收到后，笑眯眯地走了。
当然，以上这些是题外话，回归到变种人的电影拍摄。在《逆转未来》之后，木兰还续拍了五部电影，分别是：《独狼》、《孤虎》、《暮狼归乡》、《困虎犹斗》、和《天启》。
《天启》承接的是《逆转未来》成功后的世界，也是所有变种人电影作品中，唯一不存在金刚狼与剑齿虎的故事。
木兰对电影《天启》做了很大的改动。一方面，从变种人的起源上，扩展了原作中对于圣经解析。借由红恶魔与天使长都是变种人的一员，以及天启是第一位成神的变种人，电影借X教授之口，直接假设上帝就是另一位成神的变种人。并以此推展，远古的变种人早就找到了与普通人共存的方式：就是活在普通人的神话当中。这等于是在为变种人创立神系铺路。
另一方面，从天启改变世界的动机上，加入了环保和扶贫的概念。为此，木兰往电影中加入一条故事线：天启在全世界搜罗四骑士的过程中，发觉许多新生的变种人在能力觉醒时，因能力受到了“污染”而变得畸形且弱小，或者强大却不受控制；又发现许多变种人常年饥寒交迫，甚至年纪轻轻就被活活饿死。
天启随即对这两个问题展开调查。凭借个人能力，天启很快就挖掘出两大污染源：一个是来自水循环中的微塑料，一个来自许多家庭使用的不粘锅。另外，借万磁王之口，向天启（观众）解释了导致世界粮食危机的诱因，恰恰是粮食自由贸易造成的。万磁王带着天启（观众）浏览了跨过粮食企业，如何通过掌控农机设备、种子、花费这样的生产资料，达到兼并和收购发展中家国的农业，达到从粮食贸易中赚取暴利的过程。
木兰在电影《天启》中，直接点爆了DB集团，和以首字母ABCD开头的自家粮食企业。万磁王更是打破第四面墙，对着天启（屏幕前的观众）说道：“若是按照正常的法律流程，想要制止DB集团停止生产不粘锅，至少需要二十年。二十年后，全球饥饿人口有可能超过十亿。”
这才正式拉开天启改变世界的序幕。
题外话：木兰为了规避法律追责，还特意模仿这几个公司，注册了名字相似，商标也类似的牌子。电影中使用的是这些公司的缩写，与木兰注册的空壳公司一致。